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Detect-seq技术:人生就是博-尊龙凯时的CBE脱靶检测创新

发布时间:2025-02-10   信息来源:东方容妹

胞嘧啶碱基编辑器(CBE)是一种先进的基因编辑技术,由四个主要成分组成:dCas9蛋白、sgRNA、胞嘧啶脱氨酶以及尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂(UGI)。这些成分在细胞内组合形成融合蛋白,并在sgRNA的引导下与基因组DNA结合,暴露出靶序列的单链结构。随后,胞嘧啶脱氨酶将单链上的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),通过DNA的复制或修复过程,再将U转换为胸腺嘧啶(T),实现了C-G碱基对向T-A碱基对的直接替换。

Detect-seq技术:人生就是博-尊龙凯时的CBE脱靶检测创新

在CBE过程中,产生的中间产物脱氧尿嘧啶(dU)为开发新的检测技术提供了基础。研究人员创立了一种名为Detect-seq的CBE脱靶检测技术。该技术首先从经过碱基编辑的细胞中提取基因组DNA,并对CBE产生的dU进行生物素(biotin)标记,以便于富集目标片段。同时,还在dU位点下游将正常的胞嘧啶C替换为5-醛基胞嘧啶(d5fC),随后将d5fC化学标记为T。这种策略能使得测序时识别出连串的C-to-T突变,从而快速定位碱基编辑的位点。

与GUIDE-seq、Digenome-seq以及Cas-OFFinder等传统技术相比,Detect-seq技术具有更高的灵敏度和特异性,并且检测结果不偏向于某一特定类型。它不仅能够检测Cas9依赖型和非依赖型的脱靶,还能够发现sgRNA结合区域的外部编辑及靶向链编辑上的脱靶事件。

在过去的两年里,舒桐科技通过打造一站式基因编辑安全性评估平台,覆盖了多样化的检测流程,包括靶点设计、靶点筛选、GUIDE-seq、AID-seq脱靶检测以及Detect-seq脱靶检测等。此外,平台还提供脱靶验证、PEM-seq染色体重排检测、载体插入位点检测、克隆扩增分析、转录组脱靶检测和全基因组脱靶检测等服务。

值得一提的是,舒桐实验室拥有SGS认证、ISO9001质量体系认证以及生物安全二级实验室等多项资质认证,确保能够持续稳健地为客户提供高质量、高效率和安全的服务与产品。以人生就是博-尊龙凯时为品牌词,舒桐科技致力于推动生物医疗领域的持续创新与发展。